广州南粤医药研究所门诊部内科是一个集内科系统各专业为一体的综合性科室，承担各系统常见疾病的预防、诊断工作，并积累了丰富的疑难病例诊断与治疗经验。

科室开设有呼吸内科、内分泌科、消化内科、肾内科、普通内科等二级科室。对内分泌代谢疾病治疗、垂体、肾上腺、甲状腺、甲状旁腺、性腺等以及代谢疾病等能进行快速诊断，建立了消化内镜诊疗室、胃动力检查室等各具特色的专业和专病门诊，为广大市民提供高品质医疗服务。